Martín Vásquez Villanueva en su andar como funcionario en el gobierno de Oaxaca, no siempre ha salido bien librado, por su mala administración; cuando se desempeñó como secretario de Salud, en el gobierno de Ulises Ruiz Ortiz, le adjudican un desfalco millonario, el cual asciende más de 700 millones de pesos.
Vásquez Villanueva, esta mañana, a través de sus redes sociales, presentó su renuncia como director de la Corporación Oaxaqueña de Radio y Televisión, que posteriormente, antes del mediodía borró.

Sin el menor pudor, desapareció el equipo médico que debía utilizarse para combatir el cáncer de mama y cérvico-uterino; principales causas de muerte en mujeres no solo en Oaxaca, sino en todo el país.
De acuerdo con datos, el gobierno de la entidad pagó por este equipo con tecnología de punta, 118 millones de peso.
Según consta en el expediente PGR/ OAX/OAX/V/161/2011, el equipo del Proyecto Integral de Radioterapia con Acelerador Lineal nunca llegó al Almacén Estatal de Bienes de Activo Fijo de los Servicios de Salud de Oaxaca, aunque la empresa Corphomed S.A. de C.V., asegura haberlo entregado entre el 21 de agosto y el 11 de septiembre de 2008.
Pero, si medir las consecuencias, durante la investigación detectaron que en el proceso de entrega del equipo hay firmas y sellos falsificados.
En su momento, Martín Vásquez declaró que existía falsedad en el contrato de adquisición del equipo médico de radioterapia, del equipo desaparecido, si embargo, el contrato de adquisición (AD/OAX/017/07), del cual tiene una copia, lo que antes era la PGR, ahora FGR, se destaca que proyecto consistía en construir un «búnker con acelerador lineal» a un costo de 118 millones 860 mil pesos.
“Durante mi gestión de cuatro años y cuatro meses al frente de la Secretaría de Salud, jamás se realizó operación alguna de adquisición de ese equipo de alta especialización que tanto necesita el estado”.
Por otro lado, en 27 de mayo de 2011, trabajadores del sector salud, presentaron una denuncia por peculado contra el extitular de Salud.
En la averiguación previa 69/V.G/2011 acusaron a Martín Vásquez Villanueva del presunto desvío de 700 millones de pesos.